所谓的哲学根本问题或许是物质之神或精神之神精心设想的永恒的悖论

哲学是世界观和方法论的统一，是美好生活的向导。
哲学就是用简单的说话来体现出隐含深层意义的道理，让人们去思考和体会。哲学本身就是用来完善自己的精神修养和帮助他人完善思想的。
哲学的特征在于追问本质，不断反思。内容上，哲学的反思对象无所不包；深度上，哲学的反思是无穷无尽的。现实中，我们可以借用哲学的思维方式，但是不能照搬哲学的思维方式。也即是说我们能够直接关注的现实是具体而有限的，思维的不可封闭性使得我们在解决具体问题时不能进行无穷追问。
把哲学低估于现代科学是不负责任的，哲学隐藏在现实生活中的每一部分，它为我们提供了一种生活的方式，如果将哲学简单的与现代科学相提并论，则成为了一种狭隘的唯科学主义。
哲学的主要研究对象是物质与意识之间的关系。即唯心主义和唯物主义的对立关系。
凡是承认物质为第一性，意识是物质的产物，物质第一性，意识第二性的，称唯物主义者；凡称意识第一性，物质依赖与意识存在的，称唯心主义者。

首先,楼主的题目挺含糊的.
你提到了两个神,是具象的神,抽象的神,还是唯心主义者强调的意识?
从这点上讲,问题就算有某种意义上的正确性,也无法通过语言表达出来.换句话说就是等于没说.

单就楼主的问题讲,你先设定了神的存在,又指出我们研究的内容是神设定的悖论,这不等于说,你所说的是神给你的悖论,而你又指出了神的存在
显然,这问题本身就是矛盾着的.

推理A：
1 神所无所不能的，所以没有神做不到的事情。
2 所以神能够造出这样一块石头，
3 这块石头是神举不起来的。。

推理B：
1 神是无所不能的，所以没有神解释不了的结论。
2 所以神能够造出这样的结论
3 那就是永恒的悖论。

诺，这两个推理很相似的。

最终答案：楼主的题目有问题，问题如上所述

不对，
现存的几门著名的哲学都已经是一套完整的体系，不存在什么漏洞。只不过他们认知的方法、方式和结论不同。

我觉的哲学不是研究他们给设下的问题,而是研究他们本身.